Pablo
López-Gómez1, Carlos H. Avendaño-Arrazate1, Leobardo Iracheta-Donjuan1, Carolina
Barrios-Roblero1 y Rosa M. Escobedo-GraciaMedrano2, Rosa
M.
1Campo Experimental Rosario
Izapa, Instituto Nacional de Investigaciones Forestales Agrícolas y Pecuarias,
km 18 Carretera Tapachula-Cacahoatán, Tuxtla Chico, Chiapas, México, C.P.
30870.
2Unidad de Bioquímica y Biología
Molecular de Plantas, Centro de Investigación Científica de Yucatán, Calle 43,
130, Colonia Chuburná de Hidalgo, Mérida, Yucatán, C. P. 97200.
Autor de contacto: lopez.pablo@inifap.gob.mx
RESUMEN
En este trabajo se seleccionaron iniciadores basados en polimorfismo amplificado de secuencias
relacionadas (SRAP) para la
caracterización molecular de Theobroma
cacao L. Con ADN genómico de los genotipos
Carmelo, Lagarto, PMCT58, CATIER1 y CATIER6, se evaluaron un total de 43
combinaciones SRAP por PCR. Para analizar el polimorfismo, las bandas SRAP de
igual tamaño y movilidad generadas por la misma combinación para los cinco
genotipos evaluados se trataron como idénticas para ese locus. Se registró la
ausencia (0) / presencia (1) de bandas para cada locus y con ello se generó una
matriz binaria. Con la matriz se calculó la similitud genética de Jaccard. Con
los valores de similitud se generó un dendograma mediante el procedimiento de
promedios de grupos no ponderados (UPGMA).
Se generaron 312 bandas, de los cuales 143 son polimórficas. El
polimorfismo promedio fue de 44 %, el contenido de información polimórfica fue
de 0.17 y el poder de resolución por combinación de iniciadores fue de 1.92 en
promedio. Los genotipos con mayor similitud (0.96) se observó entre el CATIER1
y CATIER6, mientras que el más distante fue el PMCT58. El análisis individual
generado por cada combinación permitió seleccionar diez combinaciones de
iniciadores SRAP, los cuales serán útiles para la caracterización molecular de
cacao.
Para citar:
López-Gómez, P., Avendaño-Arrazate, C.H.,
Iracheta-Donjuan, L., Barrios-Roblero, C. y Escobedo-GraciaMedrano, R.M. (2018)
Selección de marcadores SRAP para la caracterización molecular de Theobroma cacao L. Revista del Centro de Graduados e
Investigación. Instituto Tecnológico de Mérida, 33(73),114-118
No hay comentarios:
Publicar un comentario