Estudio de los microbiomas de dos comunidades de zonas costeras diferenciadas por el impacto ambiental
Herón
Navarrete-Euán1 y Mario Alberto Martínez-Núñez2
1Universidad Autónoma de
Yucatán. Periférico Norte Km. 33.5. Tablaje Catastral 13615. Chuburná de
Hidalgo Inn. C.P. 97203 Mérida, Yucatán, México.
2Facultad de Ciencias, Unidad
Académica de Ciencias y Tecnología de la UNAM en Yucatán. Sede Parque
Científico y Tecnológico de Yucatán. México.
Autor
de correspondencia: heronnavarrete@hotmail.com
RESUMEN
Las características del ambiente
afectan el comportamiento de los seres vivos y ante el cambio, se adaptan.
Estos cambios tienen un efecto sobre las interacciones y el metabolismo de los
microorganismos, alterando así, los ciclos biogeoquímicos. Hoy en día, existe
un gran interés por conocer a los organismos implicados en estos ciclos. Las
tecnologías de secuenciación masiva de segunda generación nos permiten conocer
el ADN presente en una muestra ambiental mediante el gen 16S rRNA y con ello,
se puede obtener información más detallada, sin embargo, poseen limitantes al
develar únicamente el perfil taxonómico. En este trabajo se proporcionan las
identidades de dos microbiomas de zonas costeras de Sisal diferenciadas por
impacto antropogénico durante dos periodos de tiempo, además de predecir las funciones metabólicas
de las mismas poblaciones, siendo la reserva Estatal de El Palmar, el control.
Se encontró que los microorganismos más abundantes en ambas poblaciones son Proteobacteria,
Chloroflexi y Gemmatimonadetes. Así mismo, existe una mayor
diversidad en las muestras correspondientes al sitio afectado por la
contaminación, Sisal. En este mismo sitio durante el tiempo dos se observó un
disparo en la abundancia de vibrio. Las rutas metabólicas más presentes
en ambas muestras durante el tiempo uno fue la de los aminoácidos y
carbohidratos. En Sisal hubo una mayor presencia de rutas relacionadas con la
comunicación celular. Y con respecto a su actividad metabólica, durante el
tiempo dos se encontraron rutas relacionadas con la degradación del
etilbenceno, síntesis de vitamina B6, degradación de caprolactama, degradación
de geraniol y metabolismo de ascorbato. Poder identificar las diferencias entre
las comunidades y sus metabolismos nos puede ser útil para poder conocer los
mecanismos de adaptación al ambiente, así como la identificación de metabolitos
de interés comercial o para el uso ambiental como indicadores.
Palabras clave: Metagenómica, bioinformática, predicción metabólica
Para citar:
Navarrete-Euán, H. y Martínez-Núñez, M.A. (2018)
Estudio de los microbiomas de dos comunidades de zonas costeras diferenciadas por el impacto ambiental. Revista
del Centro de Graduados e Investigación. Instituto Tecnológico de Mérida,
33(73),281-285
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