Software para el análisis de secuencias genéticas

Software para el análisis de secuencias genéticas

Luis Felipe Carrasco-Azcuaga¹, Mario RenánMoreno-Sabido¹, Denis Israel Magaña-Ortíz², Abril Jesús Díaz-Braga² y  Elizabeth de la Luz Ortíz-Vázquez²

Tecnológico Nacional de México. Instituto Tecnológico de Mérida. ¹Departamento de Sistemas y Computación. ²Departamento de Ingeniería Química y Bioquímica. Km 5 carretera Mérida - Progreso. A.P. 911, Mérida, Yucatán, México, C.P. 97118.

Autor de contacto: mario@itmerida.mx

RESUMEN

En este trabajo se presenta el desarrollo de una herramienta de software para el análisis de secuencias genéticas. El caso de estudio en el que se enfocará este artículo es el de polen en mieles endémicas del estado de Yucatán. El objetivo de la herramienta es facilitar la generación de variantes de cadenas de ADN analizando la tabla de nucleótidos de la Unión Internacional de Química Pura y Aplicada (IUPAC, por sus siglas en inglés). Realizar este proceso manualmente significaría iterar entre cada una de las posibles combinaciones, lo que podría llevar muchas horas para poder determinarlas, además de que están latentes los errores humanos al hacerlo de esta manera. Los resultados de las pruebas demuestran que la herramienta fue de gran utilidad en este proceso, ya que por medio de una serie de funciones recursivas se logró agilizar el proceso de cálculo, lectura y almacenamiento de los cambios por secuencias equivalentes.

Palabras clave: Secuencias Genéticas / Cadenas de ADN / Barcoding Molecular / Software

Para citar:

Carrasco-Azcuaga, L.F., Moreno-Sabido, M.R., Magaña-Ortíz, D.I., Díaz-Braga, A.J. y Ortíz-Vázquez, E.L. (2018). Software para el análisis de secuencias genéticas. Revista del Centro de Graduados e Investigación. Instituto Tecnológico de Mérida, 33(74),129-134