Identificación de genes diferencialmente expresados como respuesta a la infección por Fusarium graminearum en ecotipos tolerante y susceptible de Zea mays

Identificación de genes diferencialmente expresados como respuesta a la infección por Fusarium graminearum en ecotipos tolerante y susceptible de Zea mays

Luis Joaquín Domínguez-Díaz¹, Adriana Quiroz-Moreno¹ y Elsa Beatriz Góngora-Castillo¹

¹Centro de Investigación Científica de Yucatán (CICY), A.C. Unidad de Biotecnología. Calle 46 No. 130 x 32 y 34, Chuburná de Hidalgo; CP 97205, Mérida, Yucatán; México.

Autor de correspondencia: elsa.gongora@cicy.mx

RESUMEN

A nivel mundial, el maíz (Zea mays L.) es el tercer cultivo más importante después del arroz y el trigo (Sandhu et al., 2007). Este cereal es una fuente importante de alimento para el mundo y es un cultivo básico de alto rendimiento, con un área cosechada promedio de 157 millones de hectáreas y una producción de aproximadamente 1,044 millones de toneladas anualmente (Ramírez-Cabral et al., 2017). Uno de sus principales patógenos es Fusarium graminearum que es un hongo que causa pudrición del tallo en maíz (Kazan et al. 2012). La podredumbre del tallo produce pérdidas en la producción y cosecha de las mazorcas debido a un deterioro en la formación del grano, senescencia prematura y desviación del tallo. Las plantas han desarrollado sofisticados sistemas de defensa para reconocer patógenos y activar una respuesta sistemática contra estos organismos. La caracterización de esta respuesta molecular es clave para la comprensión de las interacciones planta-patógeno (Costa-Silva et al., 2017). Utilizando la tecnología de RNA-seq se secuenciaron los transcriptomas de dos ecotipos de maíz, uno susceptible (B73) y uno tolerante (Mp717) a la infección con F. graminearum. El análisis de expresión diferencial de genes, la anotación funcional utilizando ontología de genes e identificación de funciones moleculares sobre-representadas, cuando se comparan estos dos transcriptomas, permitirá identificar diferencias en las respuestas moleculares entre los ecotipos tolerante y susceptible.

Palabras clave: Transcriptoma, Genes diferencialmente expresados, maíz, Fusarium graminearum.

Para citar:

Domínguez-Díaz¹, L.J., Quiroz-Moreno¹, A. y Góngora-Castillo¹, E.B. (2018) Identificación de genes diferencialmente expresados como respuesta a la infección por Fusarium graminearum en ecotipos tolerante y susceptible de Zea mays. Revista del Centro de Graduados e Investigación. Instituto Tecnológico de Mérida, 33(73),394-398